Пространственная структура цитотоксина II из яда кобры Naja naja oxiana в растворе и в системе, моделирующей биологическую мембрану

Пространственная структура цитотоксина II из яда кобры Naja naja oxiana в растворе и в системе, моделирующей биологическую мембрану

Автор: Дементьева, Дарья Викторовна

Шифр специальности: 02.00.10

Научная степень: Кандидатская

Год защиты: 2001

Место защиты: Москва

Количество страниц: 126 с. ил

Артикул: 2281934

Автор: Дементьева, Дарья Викторовна

Стоимость: 250 руб.

Пространственная структура цитотоксина II из яда кобры Naja naja oxiana в растворе и в системе, моделирующей биологическую мембрану  Пространственная структура цитотоксина II из яда кобры Naja naja oxiana в растворе и в системе, моделирующей биологическую мембрану 

Содержание.
Введение.
Глава I. Цитотоксины кардиотоксины из яда змей семейства Еарсае аспидов структурнофункциональные д аспекты Литературный обзор.
Первичные структуры цитотоксинов.
Эволюция цитотоксинов внутри семейства и с другими токсинами.
Пространственная структура цитотоксинов.
Механизм биологической активности.
Лизис клеток.
Деполяризация возбудимых клеток.
Влияние на активность ферментов.
Ант ибактериальная активность.
Синергизм действия с фосфолнпазой А2.
Клеточные мишени и модели связывания.
Вгаимодействие с липидами.
Белковые и углеводные мишени.
Актуальность и перспективы структурнофункциональных
исследований цитотоксинов.
Глава II. Результаты и обсуждение.
.Конформационная гетерогенность и пространственная структура цитотоксина ЦТИ из яда кобры . п. охапа в
водном растворе.
Отнесение сигналов основной и минорной компонент спектров ЯМР.
Константы спинснннового взаимодействия.
Вторичная структура.
Соотношение и обмен основной и минорной конформаций.
Прочно связанные молекулы воды.
Данные для расчета и характеристики качества полученных пространственных структур.
Пространственная структура основной формы.
Пространственная структура минорной формы.
Организация гидрофильных и гидрофобных боковых цепей ни
поверхности молекулы.
II.Комплекс цитотоксина ЦТП с мицеллами
додецилфосфохолина.
ЦТН образует комплекс с мицеллами ДФХ.
Влияние гидрофобною аниона тозилата ни связывание ЦТП с мицеллой ДФХ.
Данные для расчета и характеристики качества полученной пространственной структуры ЦТП в комплексе с мицеллой ДФХ.
Пространственная структура цитотоксина ЦТП в комплексе с мицеллой ДФХ.
Эффект 5 и доксилстеаратов на сигналы протонов ЦТП,
связанного с мицеллой ДФХ.
Конформационные особенности петли I ЦТП, важные для его
связывания с мицеллой ДФХ.
Модель комплекса ЦТИмицелла ДФХ.
Глава III. Материалы и методы.
ЦТП, ДФХ и другие материалы получение и характеристики.
Приготовление ЯМР образцов.
Спектроскопия ЯМР.
Сбор данных для расчета пространственной структуры.
Определение конформации нролиновых колец.
Боковые цепи в процедуре вычисления пространственной структуры.
Прочно связанные молекулы воды процедура поиска и включения в
расчеты пространственной структу ры.
Расчет и анализ пространственной структуры.
Построение модели комплекса ЦТПмицелла ДФХ.
Выводы.
Список литературы


Д. Овчинникова РАН ранее была определена первичная структура и проведены исследования взаимодействия с модельными мембранами цитогоксина II из яда кобры xi ДТП. Данная диссертационная работа, выполненная в лаборатории ядерного магнитного резонанса ЯМР Института, является продолжением структурнофункциональных исследований ЦТИ. Современное развитие метода ЯМР позволяет получать необходимые данные для установления высокоточных пространственных структур, подвижности и стехиометрии макромолекул в водном растворе и некоторых других средах. Детергент додецилфосфохолин ДФХ образует мицеллы, которые в отличие от мембран пригодны и традиционно используются для ЯМР исследований структурных и других основ взаимодействия с липидами мембранных и мембраносвязывающих белков. Это позволило использовать ДФХ в качестве среды, имитирующей биологическую мембрану, для исследования пространственной структуры ЦТИ. Задачами данной работы являлось определение пространственных структур ДТП в водном растворе и мицеллах ДФХ установление участков ДТП. ДФХ, и выявление их структурных особенностей получение модели комплекса ЦТмицелла ДФХ. В процессе работы было разработано несколько новых методик и подходов, которые могут использоваться в расчетах пространственных структур и моделей связывания с мицеллами других белков. В Главе I. Литературным обзором, обсуждаются современные представления о цитотоксинах кардиотоксинах, с точки зрения структуры, функции и их взаимосвязи. В основной части работы, изложенной в Главе II и состоящей из двух разделов, представлено структурнофункциональное исследование ДТП в водном растворе
и среде, моделирующей фосфолипидное мембранное окружение. Первый Раздел Главы II посвящен установлению конформационной гетерогенности ЦТИ и определению пространственной структуры двух форм ЦТИ в водном растворе. Второй Раздел посвящен установлению пространственной структуры и построению модели связывания ЦТИ в комплексе с мицеллой ДФХ. В Главе III. Материалы и Методы, приведены сведения об использованных в диссертационной работе веществах, образцах для экспериментов ЯМР. ЦТИ в комплексе с мицеллой. Основные результаты работы суммированы в Выводах. В Приложении приведены некоторые дополнительные сведения и список использованных сокращений. Глава I. Литературный обзор. Первичные структуры цитотоксинов. К настоящему времени определены аминокислотные последовательности не менее х кардиотоксинов из ядов различных змей семейства аспидов Табл. Вес представители этого класса высокоосновные белки р1. Да. Гомология среди этих белков хорошо просматривается и составляет более . Вместе с тем. ГиОоп Шбег, оказалось возможным рациональное подразделение на группы внутри класса исходя из аминокислотной последовательности см. Табл. Согласно нему вес гомологи с длиной полипептидной цепи не равной ти остаткам, отнесены к группе К. Деление остальных гомологов на четыре группы А, В, С и В связано с преодолением внутри каждой из групп низкого процента гомологии на участках с по и с по остатки. Принадлежность кардиотоксина к одной из четырех групп А0 можно определить по присутствию или отсутствию пролинов в положениях и см. Табл. Интересно, что в яде одной змеи могут существовать кардиотоксины разных подгрупп этой классификации. Локализация остатков цистеина и образованных ими дисульфидных мостиков, 3. Эволюция цитотоксинов внутри семейства и с другими токсинами. Информацию об эволюции можно получить системным сравнением аминокислотных последовательностей и выстраиванием эволюционного дерева. Для кардиотоксинов такое сравнение сильно зависит от двух уже упомянутых вариабельных участков с по и с но остатки. Однако, общепринятая методика нахождения общего предшественника и выстраивание эволюционного дерева для этих белков не работает, и наблюдается вариабельность последовательности, скорее, комбинаторного характера 2. Интересно, что в одном яде могут существовать изоформы кардиотоксина, проявляющие различные степени той или иной биологической активности, присущей семейству кардиотоксинов. Однако, до сих пор нет убедительного объяснения физиологической значимости этого явления.

Рекомендуемые диссертации данного раздела

28.06.2016

+ 100 бесплатных диссертаций

Дорогие друзья, в раздел "Бесплатные диссертации" добавлено 100 новых диссертаций. Желаем новых научных ...

15.02.2015

Добавлено 41611 диссертаций РГБ

В каталог сайта http://new-disser.ru добавлено новые диссертации РГБ 2013-2014 года. Желаем новых научных ...


Все новости

Время генерации: 0.179, запросов: 121