Молекулярные аспекты функционирования рибосомных РНК

Молекулярные аспекты функционирования рибосомных РНК

Автор: Сергиев, Петр Владимирович

Шифр специальности: 02.00.10

Научная степень: Докторская

Год защиты: 2008

Место защиты: Москва

Количество страниц: 287 с. ил.

Артикул: 4040187

Автор: Сергиев, Петр Владимирович

Стоимость: 250 руб.

Молекулярные аспекты функционирования рибосомных РНК  Молекулярные аспекты функционирования рибосомных РНК 



Как видно, изучение функционирования I3 в инициации трансляции еще далеко от завершения. Рассмотрим теперь то, что известно о функционировании другого белка, участвующего в узнавании I2. Это большой белок, содержащий ОТРазный домен домсн, сходный с доменами других СГРаз, участвующих в трансляции, , и 3. Рисунок 6. Пространственная структура I2. Представлена ленточная модель структуры гомолога инициаторного фактора 2 I5 архей М. Окраска ленты соответствует порядковому номеру аминокислоты в первичной структуре белка от конца красный к Сконцу фиолетовый. Синим цветом показана молекула . Домены инициаторного фактора подписаны. Белок I2 больше других вТРаз трансляции, его молекулярная масса достигает . В отличие от них, он содержит два дополнительных концевых домена 1 и 2. В клетках . I2, так и укороченная, не имеющая домсна . Кроме 1, 2 и доменов в аминокислотной последовательности I2 выделяют II, III и IV домены. Структура гомолога I2 архей М. I5, была определена методом РСА Рис. Каковы функции I2 в процессе инициации трансляции Инициаторный фактор 2 напрямую взаимодействует с I и, в отличие от I3, позволяет отличить 1 от и деацилированной . С формилированным метиониновым остатком взаимодействует IV домен I2 . В противовес I3, который ослаблял связывание всех тРНК с субчастицей, и лишь связывалась достаточно прочно, чтобы противостоять этому ослаблению, I2 способствует связыванию с субчастицей, не влияя на связывание других тРНК , . Уменьшение термодинамической константы диссоциации комплекса в присутствии I2 объясняется ускорением связывания тРНК , . При этом константа скорости диссоциации остается неизменной. Пожалуй, можно воспользоваться аналогией с судом, где I3 это прокурор, стремящийся к обвинительному заключению для всех тРНК, и только для невиновных 1 он не может собрать достаточно доказательств. В этом случае I2 сходен с адвокатом, стремящимся защитить все тРНК, но лишь в случае невиновности подсудимого он может выиграть дело у I3. Итак, 2 ускоряет связывание ШетРЫК1 с ЗОБ субчастицей. При этом также возрастает стабильность комплекса, поскольку константа диссоциации есть частное констант скорости диссоциации и скорости ассоциации. В трехкомпонентной системе ЗОЭ АИе1тРНКгМс1 1Р2 реализуются все парные взаимодействия и сборка такого тройного комплекса включающего, конечно, и мРНК проходит кооперативно и в произвольном порядке . Кроме связывания инициаторной тРНК, 2 также катализирует присоединение Б субчастиц , , . Самопроизвольная ассоциация рибосомных субчастиц не зависит от того, какая тРНК занимает Р участок ЗОБ субчастицы . Роль 1Р2 заключается в селективном ускорении ассоциации субчастиц, в том случае, если Р участок занимает ЯИетРНК. Так, в присутствии МеЬтРНКгМе1 или РЬе1ЯКАРЬе 2 ускоряет объединение субчастиц в 4 раза, в то время как в присутствии Ме1тРНКгМе ускоряет ассоциацию субчастиц в 0 раз . Так же, как и при связывании тРНК, 1Р2 не мешает неформилированной Мс1тРНКгМс1 или элонгаторным тРНК объединять субчастицы, но способствует быстрой ассоциации субчастиц, только если комплекс с 8 образует 1Ме1тРНКгМс . В объединении субчастиц, как и в связывании тРНК с 8 субчастицей, 1Р2 и 3 антагонисты. Согласно экспериментам, проведенным в группе Эренберга, прочное связывание ШеЬтРНК1 способствует диссоциации комплекса 1РЗ и малой субчастицы . В присутствии 2 и 1РЗ одновременно достигается более высокая селективность инициации по отношению к ЯИтРИК1, чем с любым из этих факторов по отдельности . Рисунок 7. Модель взаимодействия инициаториого фактора 1 с ЗОБ субчастицей. А. Структура комплекса Р1 и ЗОБ субчастицы, определенная методом РСА . Инициаторный фактор окрашен фиолетовым. Компоненты малой субчастицы, взаимодействующие с 1 выделены синим спираль Э рРНК, зеленым спираль Б рРНК и желтым белок 2. Красными стрелками обозначено направление движения головы и плеча ЗОБ субъединицы при схлопывании, сопровождающем связывание Р1 с А участком малой субчастицы. Б. Модель функционирования Р1 при инициации трансляции структурированных мРНК.

Рекомендуемые диссертации данного раздела

28.06.2016

+ 100 бесплатных диссертаций

Дорогие друзья, в раздел "Бесплатные диссертации" добавлено 100 новых диссертаций. Желаем новых научных ...

15.02.2015

Добавлено 41611 диссертаций РГБ

В каталог сайта http://new-disser.ru добавлено новые диссертации РГБ 2013-2014 года. Желаем новых научных ...


Все новости

Время генерации: 0.181, запросов: 121