Исследование комплементарно-адресованного алкилирования в комплексах синтетических олигонуклеотидов и их производных

Исследование комплементарно-адресованного алкилирования в комплексах синтетических олигонуклеотидов и их производных

Автор: Пичко, Наталья Петровна

Автор: Пичко, Наталья Петровна

Шифр специальности: 02.00.10

Научная степень: Кандидатская

Год защиты: 1984

Место защиты: Новосибирск

Количество страниц: 118 c. ил

Артикул: 3433774

Стоимость: 250 руб.

Исследование комплементарно-адресованного алкилирования в комплексах синтетических олигонуклеотидов и их производных  Исследование комплементарно-адресованного алкилирования в комплексах синтетических олигонуклеотидов и их производных 



В силу специфичной третичной структуры тРНК, малого размера олигонуклеотидной части реагента и, тем самым, малой прочности комплекса, представлялось необходимым исследовать вопрос о локализации точек модификации на более простой модели с прочным комплексообразованием, лишенной специфической пространственной структуры. X ТСГУ 2,4С 2хлорэтил метиламино бензилиденовым производным нонануклеотида с1ТБССАААСгА. Для выяснения некоторых закономерностей алкилирования нуклеиновых кислот бензилиденовыми производными неионных аналогов олигонуклеотидов было исследовано алкилирование полиадениловой кислоты 4 2хлорэтил Гметиламино бенвилиденовыи производным нонатимидипилуридина, этилированного по межнуклеотидным фосфатам ТрбО9ги. Впервые на модельных дезоксирибоолигонуклеотидах с известной первичной структурой реКххсстсттТББС показано, что внутрикомплексное алкилирование происходит по фрагменту рХрХ независимо от природы модифицируемого основания, а на примере алкилирования олигонуклеотида I показано, что алкилированию подвергается остаток гуанина В2 . Обнаружено, что реакции алкилирования данных олигонуклеотидов в прочном комплементарном комплексе протекают со скоростью, на 4 порядка превосходящей скорость образования этиленинмовий катиона, через который, как правило, протекают реакции алкилирования ароматическими 2хлорэтиламинами. Найдено, что при алкилировании полиА реагентами, полученными из разных фракций диастереоизомеров нонатиыидилилуридина, этилированного по межнуклеотидным фосфатам, степень модификации и направленность алкилирования зависят от набора диастереоизомеров данных реагентов. Среди реакций, протекающих в высокоспецифичных комплексах, образованных биополимерами, важное место занимают реакции, протекающие в комплементарных комплексах полинуклеотидполинуклеотид и полинуклеотидолигонуклеотид. К ним относятся процессы репарации нуклеиновых кислот, осуществляемые ДНКлигазой, химические методы синтеза межнуклеотидной связи, имитирующие лигазную сшивку, методы направленного воздействия на отдельные участки нуклеиновых кислот, а также другие реакции, моделирующие некоторые этапы эволюции. Эффективность протекания таких реакций может быть резко повышена по сравнению с реакциями вне комплекса за счет сближения реагирующих групп соседних молекул в комплементарном комплексе и ориентации их определенным образом. Реакции образования межнуклеотидной связи между олигонуклеотидами можно разделить на 2 типа I реакции, в которых активация концевой фосфатной группы одного из олигонуклеотидов происходит непосредственно в составе комплементарного комплекса с помощью конденсирующих агентов и 2 реакции, в которых используются предварительно активированные производные нуклеотидов или олигонуклеотидов. Рассмотрим отдельно реакции каждого иэ двух типов. Реакции с непосредственной активацией олигонуклеотидов в комплементарном комплексе. Б г. Нейлор и Гилхэм впервые предложили проводить
конденсацию олигонуклеотидов на комплементарной матрице в присутствии водорастворимых карбодиимидов
с6н1,. СН3 . Конденсацией рс1Т6 на полиА в присутствии 0, М карбодиимида У1, 1М 1 при 6 был получен додекатимидилат рТ с 5ым выходом. В отсутствие полиА или карбодиимида У1 обравование додекатимидилата не наблюдалось. Низкий выход продукта конденсации авторы объясняют либо недостатком стерической жесткости гидроксильной и фосфомоноэфирных групп реагирующих молекул, либо наличием большого расстояния между этими группами,которое препятствует образованию межнуклеотидных связей в составе комплекса. Это могло быть связано с недостаточным стэкингвзаимодействием между конденсирующимися олиготимидилатами. Можно было ожидать, что замена пиримидиновых олигонуклеотидов пуриновыми значительно увеличит выход реакции конденсации. Действительно, Салстон и др. У. В данном случае основными продуктами реакции бы
ли динуклеозидмонофосфаты А рА И А рА с ым и 5ым выходом соответственно и тринуклеозиддифосфат АрАрА выход 1,4 с преимущественным образованием связей. В отсутствие полии
наблюдалось образование динуклеотидов А рА ,АрА и А рА с общим выходом 1.

Рекомендуемые диссертации данного раздела

28.06.2016

+ 100 бесплатных диссертаций

Дорогие друзья, в раздел "Бесплатные диссертации" добавлено 100 новых диссертаций. Желаем новых научных ...

15.02.2015

Добавлено 41611 диссертаций РГБ

В каталог сайта http://new-disser.ru добавлено новые диссертации РГБ 2013-2014 года. Желаем новых научных ...


Все новости

Время генерации: 0.166, запросов: 121