Новый программный комплекс для анализа спектров ЯМР высокого разрешения по полной форме линии VALISA. Применение для структурного и конформационного анализа

Новый программный комплекс для анализа спектров ЯМР высокого разрешения по полной форме линии VALISA. Применение для структурного и конформационного анализа

Автор: Зубков, Сергей Владимирович

Шифр специальности: 02.00.03

Научная степень: Кандидатская

Год защиты: 2002

Место защиты: Москва

Количество страниц: 141 с. ил

Артикул: 2304959

Автор: Зубков, Сергей Владимирович

Стоимость: 250 руб.

Новый программный комплекс для анализа спектров ЯМР высокого разрешения по полной форме линии VALISA. Применение для структурного и конформационного анализа  Новый программный комплекс для анализа спектров ЯМР высокого разрешения по полной форме линии VALISA. Применение для структурного и конформационного анализа 



Мы считаем, что подход Кастеллано и БотнерБи себя не исчерпал и он ещ может быть усовершенствован, но мы уделили внимание подходу, рассматриваемому в следуещей главе. Второй из двух классических подходов анализ по полной форме линии, изначально свободен от всех недостатков, присущих описанным выше методам. ОЧЛ . П
где в вектор параметров дополнительно входят параметры формы линии ширина на полувысотс и масштабирующий фактор амплитуды спектра . V. Никакого отнесения не требуется. Никакая информация, изначально содержавшаяся в спектре, не теряется. Впервые такой алгоритм был предложен и реализован в году в программе . Оказалось возможным проанализировать слаборазрешшше спектры, которые давали вырожденные решения при использовании изза проблем отнесения. Разумеется, и в этом случае существует целый ряд проблем, которые долгое время мешали распространению такого подхода. Препятствием для сходимости становятся шумы и сигналы примесей, искажения базовой линии, нарушения фазы и другие отклонения формы линии от идеальной. Кроме того, поверхность функционала для типичного ЯМРспектра изобилует узкими и глубокими локальными минимумами, что сильно затрудняет поиск глобального минимума. Проблема сходимости в данном случае оказывается наиболее важной, так как для анализа требуется точное начальное приближение, для которого необходимо знание спектральных параметров, в нахождении которых собственно и сос тоит анализ. Первое удовлетворительное решение этой проблемы было предложено в Стефенсоном и Бинчем и реализовано ими в программе VI в х известной как I. Они использовали свободное матричное преобразование всего спектрального контура, представленного как вектор, которое сглаживает поверхность минимизируемого функционала так. После того, как итеративная процедура его обнаруживает, преобразование повторяют с матрицей с меиыпими недиагональными элементами и меньшим сглаживающим эффектом, причем новый глобальный минимум незначительно удаляется от предыдущего. Такие итерационные циклы повторяют до тех пор, пока матрица преобразования не станет единичной, а глобальный минимум на преобразованном функционале не совпадет с истинным. Одна такая последовательность циклов называется грандциклом. Этот обходной маневр, методически родственный интегральным преобразованиям, действительно позволяет находить решения для большого числа спектров независимо от выбора начального приближения. Тем не менее, выбор матричных элементов для преобразования остается нетривиальной задачей и сама последовательность итерационных циклов оказывается слишком ресурсоемкой для большинства приложений и к тому же не допускает возможности визуального контроля за процессом сходимости. Повидимому, в силу этих причин алгоритм Стефенсона и Ьинча не получил широкого распространения. Говоря о двух основных подходах к анализу спектров ЯМР следует добавлять, если быть точным, что эти подходы являются основными для обычной фурьеспектроскопин. Но существуют и другие подходы к построению спектра из сигнала спадающей индукции. Iсм например . Основная идея этого метода заключается в том, что сравнение экспериментального спектра и теоретического на каждом шаге итерации осуществляется во временном представлении, а не в частотном. При построении функционала, описывающего близость экспериментального спектра к теоретическому, используется так называемый принцим максимальной энтропии, который уже давно применяется, например, в астрономии. Из всех возможных вариаций экспериментального спектра выбираются те, которые содержат минимум информации максимальную энтропию, что позволяет до некоторой степени гарантировать, что шум не будет принят за экспериментальные сигналы. Практическое применение этот метод получил в области анализа очень коротких по времени сигналов спадающей индукции, которыми часто приходится пользоваться в двух и трехчерной спектроскопии ЯМР, где он выполняет чисто техническую функцию восстановления спектра по сильно укороченному I. Возможно, что в будущем появятся высокоэффективные методы точного анализа сложных сискров ЯМР на основе МЕМ.

Рекомендуемые диссертации данного раздела

28.06.2016

+ 100 бесплатных диссертаций

Дорогие друзья, в раздел "Бесплатные диссертации" добавлено 100 новых диссертаций. Желаем новых научных ...

15.02.2015

Добавлено 41611 диссертаций РГБ

В каталог сайта http://new-disser.ru добавлено новые диссертации РГБ 2013-2014 года. Желаем новых научных ...


Все новости

Время генерации: 0.218, запросов: 121