Видовое разнообразие и методы диагностики фитопатогенных бактерий рода Xanthomonas, поражающих растения семейства Мятликовые (Poaceae)

• Автор: Егорова, Мария Сергеевна
• Шифр специальности: 06.01.07
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2015
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 132 с. : ил.

1.1 Видовой состав и распространенность возбудителей рода ХаЫкотопаз на растениях семейства Мятликовые
1.2. Биологические особенности возбудителей бактериальных заболеваний злаковых культур
1.2.1 Культурально-морфологические свойства возбудителей
1.2.2 Симптомы проявления бактериозов
1.3.Методы диагностики фитопатогенных бактерий
1.4. Методы защиты от возбудителей бактериозов на злаковых культурах
ГЛАВА II. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
ГЛАВАШ. ИЗУЧЕНИЕ ВИДОВОГО РАЗНООБРАЗИЯ
ФИТОПАТОГЕННЫХ БАКТЕРИЙ РОДА ХАтНОМОЫАБ,
ПОРАЖАЮЩИХ ЗЛАКОВЫЕ КУЛЬТУРЫ
3.1.Видовой состав возбудителей рода Хапбготопав, поражающих растения семейства Мятликовые
3.2.Изучение генетического разнообразия исследуемой коллекции ХапЛотопаз эрр. с помощью метода мультилокусного генотипирования (МЬБТ)
3.3. Оценка вирулентности штаммов
ГЛАВА IV. УСОВЕРШЕНСТВОВАНИЕ МЕТОДОВ ДИАГНОСТИКИ ФИТОПАТОГЕННЫХ БАКТЕРИЙ РОДА ХАтНОМОЫАБ,
ПОРАЖАЮЖИХ ЗЛАКОВЫЕ КУЛЬТУРЫ
4.1 Оптимизация метода выделения бактерий из семян ячменя и риса
4.2. Идентификация возбудителей бактериозов методом классической ПЦР и прямого секвенирования
4.3. Разработка методов выявления и идентификации ХапЛотопав огугае и
ХапЛотопав агЪопсо1а методом ПЦР «в реальном времени»
4.4. Применение БИО-ПЦР и сравнение чувствительности данного метода с постановкой прямого ПЦР анализа
ГЛАВА V. ПОИСК ЭФФЕКТИВНЫХ ПРИЕМОВ ЗАЩИТЫ ОТ
ВОЗБУДИТЕЛЯ БАКТЕРИАЛЬНОГО ОЖОГА ЛИСТЬЕВ РИСА
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
ПРИЛОЖЕНИЕ

Актуальность работы. Семейство Мятликовых (Роасеае) (Злаки) -наиболее важное в хозяйственном отношении семейство растений. К нему принадлежат культуры, обеспечивающие основную часть пищевых потребностей человечества.
Злаковые культуры занимают примерно половину посевной площади мира и выращиваются практически везде, где живут люди. Основные растения - пшеница, рис, кукуруза, а также целый ряд других культур (рожь, ячмень, овес, сорго, просо и другие) возделываются на 699 млн. га, что составляет 46,44% обрабатываемых площадей в мире; в том числе на 41,9 млн. га, что составляет 59,65 % земель сельскохозяйственного назначения в РФ (FAOSTAT 2011).
В настоящее время рынок зерна контролируют пять основных экспортеров: США, Австралия, Канада, ЕС, Аргентина. Суммарное
количество зерна со стороны основной "пятерки" экспортеров составляют более 84 % всего объема мировой торговли. США, на долю, которой приходится 28 % объема торговли, занимает ведущее положение на рынке зерна, далее идут Канада -17%, Австралия и ЕС - по 15 % и Аргентина - 11 %
На долю России приходится около 10% всех пахотных земель мира. Выращивание зерновых культур является одной из базовых составляющих России. На долю посевов в России в 2012 году приходилось 58% общей площади. Основные площади для выращивания зерновых культур традиционно принадлежат пшенице и ячменю. На их долю суммарно приходится более 75%. Вместе с тем, необходимо отметить, что максимальные посевные площади под посевом зерновых отмечались в 2001, 2002 и 2009 годах - более 47 млн. га, а в 2010 году они снизились до 43,2 млн. га и в 2011 году составили 44,2 млн. га
Одним из сдерживающих факторов повышения продуктивности сельскохозяйственного производства является ряд опасных возбудителей

основная задача учреждений, осуществляющих фитосанитарный надзор диагностировать и предотвратить распространение наиболее опасных объектов на этапе досмотра импортной продукции.
3.1.Видовой состав возбудителей рода Xanthomonas, поражающих растения семейства Мятликовые
Для изучения видового состава фитопатогенных бактерий рода Xanthomonas на растениях сем. Мятликовые было исследовано более 900 образцов зерновых культур (листья, колосья и стебли озимой и яровой пшеницы, ржи, ячменя и овса), собранных сотрудниками ВНИИ фитопатологии в 2004-2013 гг. в 113 точках сборах (приложение 4). Совместно с лабораторией бактериологии ФГБУ «ВНИИКР» было исследованы более 126 партий семян риса (урожай 2011-2012 года) отечественного производства на наличии бактериального ожога и бактериальной полосчатости риса, вызываемого бактериями Xanthomonas oryzae pv.oryzae и Xanthomonas oryzae pv.oryzicola, а также других видов Xanthomonas spp (табл. 3.1.1). Образцы пшеницы, ячменя и ржи с подозрением на наличие бактериальной инфекции были предоставлены испытательной лабораторией Российской академии наук Института общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН (табл.3.1.2).
В результате проведенных обследований сотрудниками ВНИИФ в различных климатических зонах России было обнаружено повсеместное распространение бактериальных болезней на посевах зерновых культур, но наиболее распространенными были базальный (basal glume rot, возбудитель-Pseudomonas syringae pv. atrofaciens) и черный бактериозы (black-chaff/leaf stripe, возбудитель Xanthomonas X. translucens/arboricola).
Анализ соотношений вышеуказанных патогенов позволил предположить, что черный бактериоз чаще встречался в южных регионах России, таких как Краснодарский край, Кабардино-Балкария, Осетия и в Центральной Черноземной зоне. По данным ГНУ-ВНИИ фитопатологии РАСХН потери урожая от этой болезни не превышали 10-15%.