Разработка мишеней для терапии колоректального рака на основе функциональной геномики

• Автор: Коротаева, Александра Алексеевна
• Шифр специальности: 03.02.07
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2013
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 105 с. : 29 ил.

СОДЕРЖАНИЕ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
ВВЕДЕНИЕ
ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1. ПОЛИПОЗ И КОЛОРЕКТАЛЬНЫЙ РАК
2. РОЛЬ МУТАЦИЙ В ГЕНАХ МУН И АРС ПРИ ПОЛИПОЗНОМ КОЛОРЕКТАЛЬНОМ РАКЕ
3. ГЕНЫ СЕМЕЙСТВА МУС
4. ГЕНЫ СЕМЕЙСТВА RAS
5. ДЕЙСТВИЕ ОКСАЛИПЛАТИНА ПРИ ЛЕЧЕНИИ КОЛОРЕКТАЛЬНОГО РАКА
6. ГЕНЫ РЕПАРАЦИИ
7. ГЕНЫ, ОТВЕЧАЮЩИЕ ЗА ЦЕЛОСТНОСТЬ ГЕНОМА
8. АПОПТОЗ - ПРОГРАМИРУЕМАЯ КЛЕТОЧНАЯ ГИБЕЛЬ
9. ГЕНЫ ИНГИБИТОРЫ АПОПТОЗА
10. РЕГУЛЯТОРНЫЕ МЕХАНИЗМЫ БЕЖОВ СЕМЕЙСТВА IAP В АПОПТОЗЕ
11. РНК-ИНТЕРФЕРЕНЦИЯ
12. ИНГИБИРОВАНИЕ ПОТЕНЦИАЛЬНЫХ ГЕНОВ МИШЕНЕЙ В КОМБИНИРОВАННОЙ ТЕРАПИИ РАКА
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
1. ПОЛУЧЕНИЕ И КУЛЬТИВИРОВАНИЕ КЛЕТОЧНЫХ ЛИНИЙ
2. КОНСТРУИРОВАНИЕ миРНК
3. ТРАНСФЕКЦИЯ КЛЕТОК ПРЯМЫМ МЕТОДОМ И ОБРАБОТКА

ОКСАЛИПЛАТИНОМ
4. ФЛУОРЕСЦЕНТНАЯ МИКРОСКОПИЯ
5. АНАЛИЗ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ
5Л ВЫДЕЛЕНИЕ РНК
5.2 ПРОВЕДЕНИЕ РЕАКЦИИ ОБРАТНОЙ ТРАНСКРИПЦИИ
5.3 ПЦР В РЕАЛЬНОМ ВРЕМЕНИ С ПРОДУКТАМИ ОБРАТНОЙ ТРАНСКРИПЦИИ
6. КЛИНИЧЕСКИЕ ИССЛЕДОВАНИЯ
7. АНАЛИЗ ПЕРВИЧНОЙ СТРУКТУРЫ ГЕНА АРС И ГЕНА MYH
7.1 ВЫДЕЛЕНИЕ ДНК
7.2 ПЦР (ПОЛИМЕРАЗНАЯ ЦЕПНАЯ РЕАКЦИЯ)
7.3 ОЦЕНКА КАЧЕСТВА ПЦР
7.4 ОБРАЗОВАНИЕ ГЕТЕРОДУПЛЕКСНЬТХ ФРАГМЕНТОВ ДНК
7.5 ЭЛЕКТРОФОРЕЗ
7.6 ОКРАСКА ГЕЛЯ
7.7 АВТОМАТИЧЕСКОЕ СЕКВЕНИРОВАНИЕ
8. СТАТИСТИЧЕСКАЯ ОБРАБОТКА РЕЗУЛЬТАТОВ
РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЯ
1. АНАЛИЗ ИНГИБИРОВАНИЯ ГЕНА C-MYC В КАЧЕСТВЕ МИШЕНИ ТАРГЕТНОЙ ТЕРАПИИ
2. ЗАВИСИМОСТЬ АПОПТОТИЧЕСКОГО ЭФФЕКТА ОТ ДОЗЫ И ВРЕМЕНИ ВОЗДЕЙСТВИЯ ОКСАЛИПЛАТИНА
3. ПРОФИЛИ ЭКСПРЕССИ ГЕНОВ В КУЛЬТУРЕ КЛЕТОК НТ-29 ПРИ ДЕЙСТВИИ ОКСАЛИПЛАТИНА
4. ИЗУЧЕНИЕ АПОПТОТИЧЕСКОГО ЭФФЕКТА В КЛЕТКАХ КОЛОРЕКТАЛЬНОГО РАКА КУЛЬТУРЫ НТ-29 ПРИ

ИНГИБИРОВАНИИ ВЫЯВЛЕННЫХ ГЕНОВ-МИШЕНЕЙ
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

С в цитозоль, который, оказавшись там, активирует каспазу-9 и каспазу-3, запускающие апоптоз. Другая теория предполагает, что белки Rho принимают участие в активации Bcl-2, Мс1-1 и Bid. Угнетение Rho уменьшает выработку белков-антиапоптотиков Вс1-2 и Мс1-1 и увеличивает концентрацию белков-проапоптотиков Bid, не оказывая влияния на концентрацию Вах и FLIP. Угнетение Rho запускает апоптоз каспаз-9 и каспаз-3-зависимый в культуру эндотелиоцитов человека. Сегодня достаточно убедительно показано, что повышенная экспрессия генов семейства Bel блокирует гибель клеток рака молочной железы. Таким образом, гиперэкспрессия генов семейства Bel или других ингибиторов апоптоза не только способствует развитию злокачественной опухоли, но и определяет резистентность к химиолучевой терапии. Продукты гена Bcl-2 ингибируют апоптоз, индуцированный цисплатином и этопозидом. Таким образом, этот белок повышает резистентность опухоли к химиотерапевтическим агентам [Portt et al, 2011].
Гены IAP (Inhibitors of Apoptosis Proteins) впервые были обнаружены в клетках насекомых SF-21, инфецированных бакуловирусом. Было показано, что IAP ген имеет размер 1,6 кб, кодирует белок размером 35 кДа [Crook et al., 1993]. В последующих исследованиях было идентифицировано несколько различных LAP генов, которые были выделены в отдельную группу - семейство IAP генов. К настоящему времени идентифицировано множество членов этого IAP семейства у разных видов в диапазоне от вирусов до млекопитающих [Wei et al., 2008].