Скрининг аллелей BoLA-DRB3 в популяциях крупного рогатого скота различных пород

• Автор: Быкова, Александра Сергеевна
• Шифр специальности: 03.02.07, 06.02.07
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2011
• Место защиты: Дубровицы
• Количество страниц: 110 с. : ил.

Оглавление
Краткий словарь
ВВЕДЕНИЕ
1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1. Лейкоз крупного рогатого скота
1.1.1. Основные симптомы. Развитие и течение заболевания
1.1.2. Бессимптомное вирусоносительство
1.2. Вирус лейкоза КРС
1.2.1. Характеристика возбудителя лейкоза
1.2.2. Передача вируса, пути заражения
1.2.3. Опасность ВЛКРС для человека
1.3. Методы определения лейкоза
1.3.1. РИД. Достоинства и недостатки
1.3.2. ИФА. Достоинства и недостатки
1.3.3. ПЦР. Достоинства и недостатки
1.4. Главный комплекс гистосовместимости
1.4.1. Структура ГКГ
1.4.2. Ген Bola-DRB3. Его связь с лейкозом и другими заболеваниями
1.5. Методы детекции аллелей Bola-DRB3
1.5.1.ПЦР-ПДРФ по van Eijk
1.5.2.Модификации метода ПЦР-ПДРФ;
1.5.3.Метод аллельспецифичной ПЦР для определения аллеля ER
2. МАТЕРИАЛЫ-И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЙ
2.1 Материалы исследований
2.2. Методы исследований
3. РЕЗУЛЬТАТЫ СОБСТВЕННЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ
3.1. Характеристика исследованной выборки животных
3.2. Разработка системы скрининга аллелей гена BoLA-DRB3, способствующих устойчивости к лейкозу КРС
3.2.1. Исследование фрагмента гена BoLA-DRB3
3.2.2. Разработка системы генотипирования на основе пиросеквенирования и создание банка референтных образцов
3.2.3. Разработка системы генотипирования в режиме скрининга на основе аллель-специфичной ПЦР
3.3. Определение частот встречаемости «желательных» аллелей и генотипов BoLA-DRB3

3.4. Анализ распределения носителей ВЛКРС в зависимоти от генотипа по ВоЬА-БКВЗ
3.5. Анализ уровня молочной продуктивности коров в зависимости от статуса по ВЛКРС и генотипа по ВоЬАТЖВЗ
3.5.1. Влияние статуса по ВЛКРС на уровень
молочной продуктивности коров
3.5.2. Влияние генотипа по гену ВоЬА-БКВЗ на уровень молочной продуктивности коров
3.5.3. Комплексное влияние генотипа по гену ВоЬА-1ЖВЗ и статуса по ВЖРС на уровень молочной продуктивности коров
3.6. Оценка влияния линейной принадлежности коров на распределение аллелей ВоЬАТЖВЗ и статус по ВЛКРС
3.6.1. Анализ молочной продуктивности коров различных генеалогических линий и происхождения
3.6.2. Полиморфизм гена ВоЬА-ЕЖВЗ у коров черно-пестрой породы различных генеалогических линий
3.6.3. Связь линейной принадлежноста коров со статусом по ВЛКРС
3.6.4. Распределение генотипов и аллелей ВоТА-ГЖВЗ у дочерей различных быков-производителей
3.6.5. Оценка влияния фактора быка на количество носителей ВЛКРС среди дочерей
3.7. Анализ взаимосвязей между исследованными факторами и показателями молочной продуктивности коров
3.6.1. Анализ взаимосвязей исследованных факторов во всей выборке
3.7.2. Анализ связей исследованных факторов у коров черно-пестрой и
красной горбатовской породы
ВЫВОДЫ
ПРАКТИЧЕСКИЕ ПРЕДЛОЖЕНИЯ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
Приложение

Краткий словарь
ПЦР - полимеразная цепная реакция.
ГКГ - главный комплекс гистосовместимости.
В oLA- Bovine Leukocyte Antigens - лейкоцитарные антигены крупного рогатого скота.
BoLA-DRB3 -один из генов локуса DR в классе Па подрегиона BoLA главного комплекса гистосовместимости.
МНС - Major Histocompatibility Complex — главный комплекс гистосовместимости. Ч
BLV - Bovine Leukemia Virus - вирус лейкоза крупного рогатого скота.
PSQ - пиросеквенирование.
PSQ-PCR - ПЦР с последующим пиросеквенированием продуктов амплификации.
Амплификация - многократное увеличение копий исследуемого фрагмента ДНК при проведении полимеразной цепной реакции.
П.о. - пары оснований.
Праймеры - синтетические олигонуклеотидные последовательности длиной около 20 п.о., фланкирующие исследуемый фрагмент ДНК.
Отжиг праймеров - гибридизация праймеров с ДНК в процессе амплификации.
ПДРФ — полиморфизм длин рестрикционных фрагментов
Рестрикция - расщепление ДНК специфическими ферментами (рестрикционными эндонуклеазами, рестриктазами) в определенных местах -сайтах рестрикции.
ВЛКРС - вирус лейкоза крупного рогатого скота
АС-ПЦР - аллель-специфичная ПЦР

2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЙ.
Исследования проводили в Центре биотехнологии и молекулярной диагностики животных ГНУ Всероссийский научно-исследовательский институт животноводства Российской академии сельскохозяйственных наук в период с 2007 по 2010 гг. по схеме, приведенной ниже (рис.1)
Рис. 1. Схема проведенных исследований