Определение фенотипических и молекулярно-генетических характеристик штаммов Neisseria meningitidis, Haemophilus influenzae и Streptococcus pneumoniae, выделенных из ликвора детей, больных гнойным бактериальным менингитом

• Автор: Урбан, Юлия Николаевна
• Шифр специальности: 03.02.03
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2014
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 117 с. : ил.

ОГЛАВЛЕНИЕ
ОГЛАВЛЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1.Основные возбудители гнойного бактериального менингита
Л Л.Streptococcus pneumoniae. Факторы патогенности, серотипы
1.1. 2.Neisseria meningitidis. Факторы патогенности, серогруппы
1.1.3. Haemophilus influenzae. Факторы патогенности, серотипы
1.2.Устойчивость основных возбудителей гнойного бактериального менингита к антибиотикам
1.3. Лабораторная диагностика гнойного бактериального менингита
1.4. Методы внутривидовой дифференцировки и анализ популяционной структуры N.meningitidis, S. pneumoniae и Н. influenzae
1.5. Вакцинопрофилактика
СОБСТВЕННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ
ГЛАВА 2. АНАЛИЗ РАСПОСТРАНЕНИЯ ОСНОВНЫХ ВОЗБУДИТЕЛЕЙ ГНОЙНОГО БАКТЕРИАЛЬНОГО МЕНИНГИТА В СТРАНАХ СНГ
2.1.Идентификация возбудителей гнойного бактериального менингита в спинномозговой жидкости
2.2. Характеристика выделенных штаммов
ГЛАВА 3. ПРОФИЛИ ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТИ К АНТИБАКТЕРИАЛЬНЫМ ПРЕПАРАТАМ ВОЗБУДИТЕЛЕЙ ГНОЙНОГО БАКТЕРИАЛЬНОГО МЕНИНГИТА, ВЫДЕЛЕНЫХ ИЗ СМЖ БОЛЬНЫХ ДЕТЕЙ
3.1. Анализ антибиотикочувствительности штаммов S.pneumoniae
3.2. Анализ антибиотикочувствительности штаммов N. meningitidis
3.3. Анализ антибиотикочувствительности штаммов Н.influenzae
ГЛАВА 4. ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ШТАММОВ, ВЫДЕЛЕННЫХ ИЗ СМЖ

4.1. Мультилокусное сиквенс-типирование штаммов S.pneumoniae
4.2. Мультилокусное сиквенс-типирование штаммов N.meningitidis.
4.3. Мультилокусное сиквенс-типирование штаммов H.influenzae
ГЛАВА 5. СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ ШТАММОВ S. pneumoniae, ВЫЗЫВАЮЩИХ ИНВАЗИВНЫЕ И НЕИНВАЗИВНЫЕ ФОРМЫ ИНФЕКЦИЙ
ГЛАВА 6. АЛГОРИТМ ИДЕНТИФИКАЦИИ ВОЗБУДИТЕЛЕЙ ГНОЙНОГО
БАКТЕРИАЛЬНОГО МЕНИНГИТА
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ
ПРЕСПЕКТИВЫ ДАЛЬНЕЙШЕЙ РАЗРАБОТКИ ТЕМЫ
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

ВВЕДЕНИЕ. Актуальность темы исследования
Гнойный бактериальный менингит (ГБМ), как форма инфекционной нейропатологии, занимает важное место в структуре заболеваний нервной системы и остается одной из причин летальности и инвалидизации больных. Во всем мире ведущими возбудителями бактериального менингита Neisseria meningitidis (менингококк), Streptococcus pneumoniae (пневмококк) Haemophilus influenzae тип b (Hib) [28, 47,180,181].
Ежегодно в мире по расчетным данным регистрируется более 1,2 миллиона случаев бактериальных менингитов [181]. Показатели заболеваемости и летальности от бактериальных менингитов колеблются в зависимости от региона, страны, конкретного патогена и возрастной группы. При отсутствии лечения уровень летальности может доходить до 70 процентов, а у одного из каждых пяти выживших после бактериальных менингитов могут возникать осложнения, включая тугоухость, неврологические расстройства [28, 29, 181].
Для идентификации N. meningitidis, S. pneumoniae и Н. influenzae широко используются микробиологические методы: бактериологический метод, микроскопический метод, иммунохимический метод (реакция латекс - агглютинации). Хотя бактериологический метод и принято считать золотым стандартом для подтверждения случаев заболевания в условиях клиники, уровень положительных результатов этого исследования относительно низок по причине несоблюдения оптимальных условий хранения и транспортировки материала и/или проведения антибактериальной терапии до взятия клинического материала, а учет результатов реакции латекс - агглютинации носит субъективный характер и может быть сложным для интерпретации [28, 181]. Поэтому в последние годы, для диагностики основных возбудителей бактериального менингита широко применяются молекулярные методы, в частности метод полимеразной цепной реакции (ПЦР). Этот метод позволяет обнаружить специфическую ДНК патогенных бактериальных агентов и для этого не требуются живые бактериальные клетки. В настоящее время ПЦР находит широкое применение в диагностике и эпиднадзоре за патоген-

проникают далее в кровяное русло, в результате чего развивается бактериемия, протекающая транзиторно, или приводящая к генерализации инфекции с формированием вторичных очагов и поражением центральной нервной системы (ЦНС) [43, 165]. Ключевым этапом в патогенезе ГМБ является проникновение возбудителя через гематоэнцефалический барьер (ГЭБ) на фоне бактериемии [32]. Факторы патогенности, которыми обладают возбудители бактериального менингита, позволяют им проникать в спинномозговую жидкость (СМЖ), циркулирующую в субарахноидальном пространстве [43, 170]. Далее возбудители размножаются в СМЖ, развивается воспалительный процесс в оболочках и сосудах головного мозга, происходит активация локальных иммунных реакций (макрофагальная реакция микроглии и астроглии, “цитокиновый взрыв”, продукция нейропептидов и др.), приводящая к внутричерепной гипертензии и, как следствие, отеку головного мозга (ГМ) [47].. Развитие отека ГМ, синдромов вклинения и образование мозговых грыж являются непосредственными причинами летального исхода [24, 47].
l.l.l.Streptococcuspneumoniae. Факторы патогенности, серотипы
Вид S.pneumoniae - относится к факультативно-анаэробным грамположи-тельным коккам рода Streptococcus, семейства Streptococcaceae. Морфотип характеризуется овальными или ланцетовидными диплококками, окруженными типоспецифичной капсулой [20, 26, 27, 68]. Для S. pneumoniae характерны следующие факторы вирулентности: полисахаридная капсула, протеаза секреторного иммуноглобулина (slgA), пневмолизин, тейхоевые кислоты, фрагменты пептидо-гликана, поверхностный клеточный адгезии, аутолизин [26, 68, 170].
Несмотря на то, что пневмококковый капсулярный полисахарид не обладает прямым токсическим действием, именно он является основным фактором патогенности микроорганизма. Капсульный полисахарид, проявляя антифагоцитар-ную активность, препятствует комплемент-зависимому лизису бактерий, тем самым способствуя нарушению фагоцитоза пневмококков полиморфоядерными лейкоцитами. Кроме того он играет ключевую роль в индукции воспалительных процессов [37, 170]. В настоящее время, на основании химических различий в