Элементы генома, ответственные за развитие основных групп генетически детерминируемых болезней человека

• Автор: Мяндина, Галина Ивановна
• Шифр специальности: 03.00.15
• Научная степень: Докторская
• Год защиты: 2005
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 298 с. : ил.

* Список сокращений
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1. Элементы генома вирусного происхождения и их
роль в процессе онкогенеза
1.2. Таксономия ретровирусов
^ 1.2.1. Репликативный цикл ретровируса типа О МейзонаПфайзера
1.2.2. Организация генома вируса Мейзона-Пфайзера
1.2.3. Ассоциация вируса Мейзона-Пфайзера с
патологией человека
1.3. Вирус Эпштейна-Барр
1.3.1. Геном вируса Эпштейна-Барр
1.3.2. Полиморфизм генома ВЭБ
1.3.3. Гены литической инфекции ВЭБ
1.3.4. Гены латентной инфекции ВЭБ
ф 1.3.5. Трансформирующая функция белков латентной
инфекции ВЭБ
1.3.6. Строение и функции белка ЕВЫА-ЗС
1.3.7. Ассоциация ВЭБ с развитием злокачественных
заболеваний
1.4. Вирусы папиллом человека
• 1.4.1. Организация генома ВПЧ
а 1.4.2. Патогенез ВПЧ
1.4.3. Роль ВПЧ в развитии онкологических заболеваний органов мочеполовой системы
1.5. Генетическая предрасположенность к развитию онкологических заболеваний
1.6. Роль генетических факторов в развитии поздних гестозов беременных
1.7. Молекулы клеточной адгезии
1.7.1. Структурная модель интегринов
1.7.2. Интегрины и сигналинг
1.7.3. Гликопротеиновый комплекс СРИЬ-вРШа . Полиморфизм аллоантигенной системы тромбоцитов РЦА)
1.7.4. Роль гликопротеинового комплекса СРИЬ-вРШа в развитии атеросклероза
1.7.5. Роль интегринов в эмбриогенезе
1.7.6. Роль интегринов в развитии опухолей
1.8. Гены системы метаболизма этанола
1.8.1. Популяционные различия полиморфизма генов системы метаболизма этанола
1.8.2. Полиморфизм ферментов метаболизма этанола и риск развития алкогольной патологии
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЙ
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ.
3.1. Исследование элементов генома вирусного происхождения.
3.1.1. Детекция ДНК вируса Эпштейн-Барр в клетках
периферической крови методом ПЦР.
3.1.2. Полиморфный элемент гена ЕВЫА-ЗС вируса Эпштейн-Барр
3.2. Интеграция ретровируса типа О Мейзона -Пфайзера в хромосомы человека
3.2.1. Амплификация методом селективной ПЦР-супрессии концевых участков вирусной ДНК и прилегающих участков ДНК человека
3.2.2. Гибридизация по Саузерну продуктов ПЦР, содержащих концевые участки вирусной ДНК и прилегающие участки ДНК человека
3.2.3. Создание библиотеки клонов
3.2.4. Скрининг бибилиотеки и селекция клонов, содержащих концевые участки вирусной ДНК и прилегающие участки генома человека
3.2.5. Анализ нуклеотидной последовательности вставки рекомбинантного клона
3.2.6. Подтверждение наличия ЬТИ. вируса Мейзона-Пфайзера в 17-ой хромосоме человека
3.2.7. Анализ сайтов интеграции последовательностей вируса Мейзона-Пфайзера в хромосомы человека
3.2.8. Характеристика участков разрывов ЬТЯ вируса
3.2.9. Функциональная характеристика участков генома человека, в которые произошла интеграция МРМУ
3.2.10. Обсуждение результатов раздела 3.2.
3.3. Детекция элементов генома вируса папилломы человека типа 16 в клетках опухолей и периферической крови пациентов, страдающих раком мочевого пузыря.
3.3.1. Анализ ДНК, выделенной из клеток
белками Jk и PU.l, затем происходит связывание с ДНК основных транскрипционных факторов TFIIB, TAF40 и TFIIH [180, 220, 313].
Гены EBNA-3A, EBNA -ЗВ, EBNA -ЗС кодируют белки, размер которых составляет 944, 938 и 992 а.о., соответственно. Каждый ген EBNA-3 состоит из двух экзонов, короткого интрона и содержит повторы в С-концевом участке ДНК. Анализ генов EBNA-3 в рекомбинантных штаммах ВЭБ показал, что трансформирующей активностью обладают только EBNA-ЗА и EBNA-3C [220, 228, 445].
Белок EBNA-ЗС индуцирует экспрессию клеточного рецептора CD23, а также конкурирует с EBNA-2 за возможность связываться с клетчным белком Jk, что уменьшает трансформирующую активность EBNA-2. Более того, соединение EBNA-ЗС с белком Jk приводит к ингибированию способности белка Jk связывать консенсусные последовательности ДНК [254, 422, 444, 446].
Экспрессия гена EBNA-1 является необходимым условием для поддержания генома ВЭБ в виде эписомы в латентно инфицированных клетках. Консенсусные последовательности ДНК для кодирования белка EBNA-1, включающего 641 а. о., расположены в трех различных участках генома вируса Эпшейна-Барр [227, 228].
Ген LMP1 является основным онкогеном, который экспрессируется во время латентной ВЭБ инфекции [39, 334, 414]. Белок LMP1 включает 386 а.
о. и состоит из N - концевого домена (25 а.о.), шести гидрофобных трансмембранных доменов (по 20 а.о.), разделенных пятью спиральными участками, и С- концевого цитоплазматического домена (200 а. о.) [335].
Вирусный белок LMP1 не имеет аналогов среди всех известных белков. Экспрессируясь в инфицирванных клетках, LMP1 внедряется в цитоплазматическую мембрану, сворачиваясь в виде колпачков, похожих на активированные рецепторы факторов роста. Первые 44 а. о. С-концевого домена взаимодействуют с клеточными факторами TRAFs (tumor necrosis factor receptor- assciated factors). TRAFs взаимодействуют с клеточным