Анализ генов предрасположенности к туберкулезу легких в Республике Башкортостан

• Автор: Имангулова, Миляуша Мусиевна
• Шифр специальности: 03.00.15
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2005
• Место защиты: Уфа
• Количество страниц: 246 с. : ил.

Глава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1 Эпидемиология туберкулеза
1.2 Этиология. Патогенез. Классификация основных форм туберкулеза
1.3 Туберкулез как сложное многофакторное заболевание
1.4 Гены предрасположенности к туберкулезу легких
1.4.1 Гены главного комплекса гистосовместимости (HLA)
1.4.2 Гены цитокинов (IFNy, IFNyR, IL12, IL12R, TNFa, IL1,
ILIRa, IL10)
1.4.3 Ген NRAMP1 (Natural-Resistance-Associated-Macrophage
Protein 1 gene)
1.4.4 Г ей рецептора витамина D (VDR)
1.4.5 Ген индуцибельной синтазы окиси азота (NOS2)
1.4.6 Г ены ферментов биотрансформации ксенобиотиков
(CYP1A1, CYP2E1, GSTM1)
Глава 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
2.1 Материалы исследования
2.2 Методы исследования
2.2.1 Выделение геномной ДНК
2.2.2 Полимеразная цепная реакция синтеза ДНК
2.2.3 Рестрикционный анализ
2.2.4 Метод электрофореза в полиакриламидном геле
2.2.5 Статистическая обработка полученных результатов
Глава 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
3.1 Исследование полиморфизма генов цитокинов у больных туберкулезом легких и здоровых доноров из Республики
Башкортостан
3.1.1 Анализ ассоциаций полиморфного локуса -308G>A гена

фактора некроза опухолей (TNFA) с туберкулезом легких
<4 3.1.2 Анализ ассоциаций полиморфного локуса -511 С> Т гена
интерлейкина 1(3 (IL1B) с туберкулезом легких
3.1.3 Анализ ассоциаций полиморфного локуса 3953С>Т гена интерлейкина ip (IL1B) с туберкулезом легких
3.1.4 Анализ ассоциаций сочетаний полиморфных локусов 511С>Ти 3953С>Тгена IL1В с туберкулезом
легких
3.1.5 Анализ ассоциаций VNTR полиморфизма гена антагониста рецептора интерлейкина 1Р (IL1RA) с туберкулезом
(р легких
3.1.6 Анализ комбинаций полиморфных локусов генов IL1B и
IL1RA с туберкулезом легких
3.2 Исследование полиморфизма гена NRAMP1 у больных туберкулезом легких и здоровых доноров из Республики Башкортостан
3.2.1 Анализ ассоциаций полиморфного локуса 1729+55del4 гена NRAMP1 с туберкулезом легких
3.2.2 Анализ ассоциаций полиморфного локуса D543N гена
NRAMP1 с туберкулезом легких
3.2.3 Анализ ассоциаций сочетаний полиморфных локусов
1729+55del4 и D543N гена NRAMP1 с туберкулезом легких
3.3 Исследование полиморфизма гена рецептора витамина D (VDR) у больных туберкулезом легких и здоровых доноров из
Республики Башкортостан
3.3.Г Анализ ассоциаций Fold полиморфизма гена VDR с
туберкулезом легких
3.3.2 Анализ ассоциаций Taql полиморфизма гена VDR с
1* туберкулезом легких
3.3.3 Анализ ассоциаций сочетаний полиморфных локусов Fokl и

Taql гена VDR с туберкулезом легких
3.4 Исследование полиморфных локусов генов биотрансформации ксенобиотиков (CYP1A1, CYP2E1, GSTM1) у больных туберкулезом легких и здоровых доноров из Республики Башкортостан
3.4.1 Анализ ассоциаций полиморфного локуса Ile462Val гена
CYP1A1 с туберкулезом легких
3.4.2 Анализ ассоциаций инсерционного полиморфизма (Ins96)
гена CYP2E1 с туберкулезом легких
3.4.3 Анализ ассоциаций делеции гена GSTM1 с туберкулезом
легких
3.5 Исследование STR полиморфизма гена индуцибельной синтазы окиси азота (NOS2A) у больных туберкулезом легких и здоровых доноров из Республики Башкортостан
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
ПРИЛОЖЕНИЕ

рестрикционных локусах, названия рестриктаз и длины продуктов (• расщепления представлены в табл. 2. Рестрикцию полиморфных локусов
3080А гена ТША, -5ПОТ гена ДЛ В, Пе462Уа1 гена СУР1А1, обоих полиморфизмов гена МЯАМР! (Б543Ы, 1729+55с1е14) и Рок1 гена УТЖ проводили эндонуклеазами Вяр191, Ата8Л, Нтс11, Вте18 и Рок {1729+55с1е14 и Рок!) при температуре 37°С, тогда как ПДРФ-анализ полиморфизма +39530Т гена 1Ь1В и Тсщ полиморфизма гена КОД проводили рестриктазой ТацI при температуре 65°С в соответствие с рекомендациями фирм-производителей.
1ф 2.2.4. Метод электрофореза в полиакриламидном геле
Разделение фрагментов ДНК после амплификации и рестрикции проводили при помощи электрофореза в 7% полиакриламидном геле (ПААГ), приготовленном из 30% раствора ПААГ (соотношение акриламид:Ы,М’-метиленбисакриламид - 29:1). Электрофорез проводили в 1 хТБЕ буфере (0,089 М трис-НС1; 0,089 М борная кислота; 0,002 М ЭДТА, рН=8,0). Перед нанесением на гель пробы смешивали в соотношении 5:1 с краской, содержащей 0,25% бромфенолового синего, 0,25% ксиленцианола и 15% фикола. После окончания электрофореза гель окрашивали раствором бромистого этидия и фотографировали при УФ-освещении.
Результаты электрофоретического разделения амплифицированных фрагментов исследованных двенадцати полиморфных ДНК-локусов представлены на рис. 3 - 14.