Экологические предпосылки гетерогенности популяций хантавирусов и вирусов комплекса клещевого энцефалита в Западной Сибири

• Автор: Якименко, Валерий Викторович
• Шифр специальности: 03.00.06
• Научная степень: Докторская
• Год защиты: 2004
• Место защиты: Омск
• Количество страниц: 282 с. : ил.

Общая характеристика работы
Глава 1. Современное состояние проблемы хантавирусов (обзор
данных литературы)
1Л. Характеристика групп
1.2. Хантавирусы Старого Света
1.3. Хантавирусы Нового Света
1.4. Вопросы изменчивости и филогении хантавирусов
Глава 2. Современное состояние изученности вирусов комплекса клещевого энцефалита в Западной Сибири (обзор данных литературы)
2.1. Вирус клещевого энцефалита (ВКЭ) - распространение
и штаммовая неоднородность в Западной Сибири
2.2. Вирус омской геморрагической лихорадки - распространение
и штаммовая неоднородность в Западной Сибири
Собственные исследования
Глава 3. Материалы и методы
3.1. Методы
3.1.1. Зоопаразитологические методы
3.1.2. Методы вирусологических исследований
3.1.3. Методы филогенетического анализа
3.1.4. Экспериментальные исследования
3.2. Материалы
3.2.1. Вирусы комплекса клещевого энцефалита
3.2.2. Хантавирусы
Глава 4. Распространения и филогенетические отношения хантавирусов
в Западной Сибири
4.1. Распространение в регионе
4.1.1. Хантавирусы генотипа Топографов
4.1.2. Хантавирусы генотипа Пуумала
4.1.3. Эпидемиологические проявления природных очагов хантавирусов генотипа Пуумала в Западной Сибири
4.1.4. Хантавирусы генотипа ДобраваБелград
4.1.5. Хантавирусы генотипа Тула
Глава 5. Гетерогенность вируса клещевого энцефалита в различных
ландшафтах Западной Сибири и Алтая
5.1. Гетерогенность вируса клещевого энцефалита в подзоне

южной тайги
5.2. Ландшафтно-биотопические особенности распространения вируса клещевого энцефалита в южной тайге
5.3. Гетерогенность вируса клещевого энцефалита в северной лесостепи
5.4. Ландшафтно-биотопические особенности распространения вируса клещевого энцефалита в северной лесостепи
5.5. Гетерогенность вируса клещевого энцефалита в степной
зоне Западной Сибири
5.6. Ландшафтно-биотопические особенности распространения вируса клещевого энцефалита в степи (Западная Сибирь и Центр. Казахстан)
5.7. Гетерогенность вируса клещевого энцефалита в альпийской и субальпийской зонах Алтая
5.8. Ландшафтно-биотопические особенности распространения вируса клещевого энцефалита в в альпийской и субальпийской
зонах Алтая
Глава 6. Вирус омской геморрагической лихорадки - распространение и
гетерогенность
6.1. Современные данные по распросранению природных очагов омской геморрагической лихорадки
6.2. Оценка уровня однородности нуклеотидного состава геномов вирусов комплекса клещевого энцефалита с помощью вычисления величины взаимной информации
6.3. Оценка уровня гомологии нуклеотидного состава генов Е и
NS5 вирусов комплекса клещевого энцефалита
Глава 7. Экспериментальное изучение влияния эффекта хозяина на штаммовые характеристики вирусов комплекса клещевого энцефалита
7.1. Результаты селективного воздействия на возбудитель организма лабораторных животных (белых мышей)
7.2. Результаты селективного воздействия на возбудитель организма иксодовых клещей
7.3. Результаты селективного воздействия на возбудитель организма гамазовых клещей
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
Список основных публикаций по теме диссертации
Список использованной литературы
Приложения
1. ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА РАБОТЫ
Актуальность темы
Серьезной проблемой контроля эпидемической активности природных очагов вирусных инфекций является чередование периодов относительного эпидемического благополучия с труднопредсказуемыми периодами эпидемической активности. Так, в последние два десятилетия в России не только отмечались периодические существенные подъемы и спады заболеваемости населения такими традиционными формами, как клещевой энцефалит (КЭ) и геморрагическая лихорадка с почечным синдромом (ГЛПС), но и активизировались после длительного периода покоя природные очаги лихорадки Западного Нила (ЛЗН), Крымской-Конго (КГЛ) и омской (ОГЛ) геморрагических лихорадок.
В Российской Федерации ГЛПС по показателям заболеваемости лидирует среди зоонозных вирусных инфекций, и занимает одно из первых мест среди всех природно-очаговых болезней человека (Tkachenko et al., 1998), при этом абсолютное число случаев заболевания - 97% - приходится на Европейскую часть России, 3% - на Азиатскую часть, главным образом, на Дальний Восток (Ткаченко, 2000). Распространение очагов хантавирусов в Сибири длительное время определялось представлениями о дизъюнкции ареала хантавирусов (Лебедев, 1964). В настоящее время установлено, что из 30 серологически и/или генетически различающихся хантавирусов (Schmaljohn et al., 1983; Plusnin et al., 1994; Plusnin, et al., 1999; Avsic-Zupanc et al., 1995; Schmaljohn, Hjelle, 1997; и др.), только для 4 генотипов показана роль возбудителей ГЛПС - Хантаан, Сеул, Пуумала и Добрава (Schmaljohn, Hjelle, 1997). Сочетание новых представлений о популяционной гетерогенности состава хантавирусов, с полученными в 60х - 80х годах 20го века данными о находках хантавирусного антигена у грызунов в лесной и тундровой ландшафтных зонах Западной Сибири (Апекина и др., 1990; Мясников и др., 1984; Мясников и др., 1991),
Продолжение табл
1 2 3 4
Langat N(3003690 N0003690 Ьап&гЛ
11199-217 АВ049352 - Россия, Иркутская обл. ВКЭ
Ж99-1т4 АВ049349 - Россия, Иркутская обл. ВКЭ
0199-203 АВ049353 - Россия, Иркутская обл. ВКЭ
Ва1ка1-4 АР229362 - Россия, Иркутская обл. ВКЭ
272-75 АР231806 - Россия, Иркутская обл. ВКЭ
178-79 АР139490 - Россия, Иркутская обл. ВКЭ
УавОсЬепко АР069066 АР069066 Россия, Иркутская обл. ВКЭ
352-81 АР224667 - Россия, Бурятия ВКЭ
8ЫЬу-1 АР224666 - Россия, Красноярский край ВКЭ
81о1Ьу-4 АР231807 - Россия, Красноярский край ВКЭ
367-81 АР241773 - Россия, Восточная Сибирь ВКЭ
886-84 АР139491 - Россия, Восточная Сибирь ВКЭ
Вс^васЮ АБ224662 - Россия, Новосибирская обл. ВКЭ
Кайлп-З АР236055 - Россия, респ. Алтай ВКЭ
N11811511-2 АБ224663 - Россия, Башкирия ВКЭ
Уок>8(1а-2 АБ229364 - Россия, Вологодская обл. ВКЭ
Бетекв АБ224665 - Украина, Волынская обл. ВКЭ
263 - 1127491 З.Европа ?
3.2.2. Хантавирусы
(1). Объемы и происхождение исследованных материалов приведены в приложении 4.
(2). Использованные для филогенетического анализа нуклеотидные последовательности хантавирусов получены из ОепВапк в режиме прямого доступа, коды доступа, источники изоляции и территории происхождения приведены в табл. 8.