Взаимодействие алкилоксибензолов - ауторегуляторных d1-факторов микроорганизмов с ДНК

• Автор: Давыдова, Ольга Константиновна
• Шифр специальности: 03.00.07, 03.00.04
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2006
• Место защиты: Саратов
• Количество страниц: 127 с. : ил.

Список сокращений
Глава 1. Обзор литературы. Ауторегуляторные брфакторы микроорганизмов и возможность их воздействия на генетический аппарат бактериальной клетки
1.1. Многообразие внеклеточных ауторегуляторных брфакторов микроорганизмов и их влияние на бактериальную клетку
1.2. Основные закономерности взаимодействия низкомолекулярных лигандов с ДНК
Глава 2. Материалы и методы исследований
2.1. Объекты исследования. Приготовление образцов
2.2. Оптические методы
2.2.1. Измерение спектров поглощения
2.2.2. Регистрация спектров люминесценции
2.2.3. Термическая денатурация ДНК и измерение оптической плотности
2.3. Капиллярная вискозиметрия
2.4. Электрофорез в агарозном геле
2.5. Методы микроскопии
2.5.1. Атомно-силовая микроскопия
2.5.2. Сканирующая электронная микроскопия
2.6. Методы статистической обработки результатов
Глава 3. Доказательства взаимодействия ауторегуляторных 61-факторов с ДНК
3.1. Гипохромный эффект при взаимодействии брфакторов с ДНК
3.2. Определение характера взаимодействия (ф-факторов с ДНК люминесцентным методом

3.3. Визуализация комплексов ДНК с (^-факторами
3.4. Количественная оценка связывания молекул с1гфакторов с ДНК
3.5. Конформационный В—>А-переход молекул ДНК в присутствии ф-факторов при изменении относительной влажности
Глава 4. Устойчивость ДНК к экстремальным воздействиям в присутствии ф-факторов
4.1. Изменение температуры плавления ДНК в присутствии (11-факторов
4.2. Чувствительность ДНК к УФ-облучению в присутствии (31-факторов
4.2.1. Влияние УФ-облучения на линейные молекулы ДНК в присутствии ф.факторов
4.2.2. Влияние УФ-облучения на кольцевые молекулы ДНК в присутствии сф.факторов
4.3 Длительное сохранение физико-химических свойств ДНК в присутствии <Д .факторов
Заключение
Выводы
Список использованной литературы

Список сокращений
АОБ - алкилоксибензолы,
АСМ - атомно-силовая микроскопия,
ГР - гексилрезорцин,
ДНК - дезоксирибонуклеиновая кислота,
ИК - инфракрасный,
ККМ - критическая концентрация мицеллообразования, МР - метилрезорцин,
НК - нуклеиновая кислота, н.п. - нуклеотидная пара,
о.в. - относительная влажность,
СЭМ - сканирующая электронная микроскопия,
Т - тирозол,
УФ - ультрафиолетовый.

зование методов флюориметрии должно позволить более детально охарактеризовать сам механизм взаимодействия между ДНК и АОБ.
Предварительные данные об образовании надмолекулярных комплексов АОБ-ДНК явились основанием для использования методов атомносиловой и сканирующей электронной микроскопий, потенциально способных визуализировать результаты взаимодействия между названными молекулами, а также последовательные этапы подобного процесса.
Наконец изучение вязкостных и электрофоретических свойств образующихся комплексов после выполнения соответствующих расчетов должно позволить количественно охарактеризовать связывание АОБ с ДНК.
Необходимой составляющей подобного исследования является проведение анализа подобных явлений в зависимости от химического строения (31-факторов и их используемых концентраций, а также их согласование с известными биологическими эффектами АОБ в отношении бактериальной клетки.
3.1 Гипохромный эффект при взаимодействии (1гфакторов с ДНК
Спектр поглощения вещества определяется в первую очередь химической структурой молекулы. Однако положение максимума поглощения (Кткс) и молярный коэффициент экстинции (с) претерпевают заметные изменения под влиянием окружения. Имеется в виду влияние pH, полярности растворителя или соседних молекул и относительная ориентация соседних хромофоров. Именно эти факторы лежат в основе использования метода спектрофотометрии для характеристики макромолекул. Биологические макромолекулярные структуры характеризуются высокой упорядоченностью пространственного расположения своих составных элементов и большой степенью сложности, что сопровождается формированием специфических оптических эффектов.