+
Действующая цена700 499 руб.
Товаров:
На сумму:

Электронная библиотека диссертаций

Доставка любой диссертации в формате PDF и WORD за 499 руб. на e-mail - 20 мин. 800 000 наименований диссертаций и авторефератов. Все авторефераты диссертаций - БЕСПЛАТНО

Расширенный поиск

Изучение белка E(y)2P Drosophila melanogaster, являющегося паралогом фактора транскрипции E(y)2

  • Автор:

    Марданов, Павел Владимирович

  • Шифр специальности:

    03.00.03

  • Научная степень:

    Кандидатская

  • Год защиты:

    2005

  • Место защиты:

    Москва

  • Количество страниц:

    107 с. : ил.

  • Стоимость:

    700 р.

    499 руб.

до окончания действия скидки
00
00
00
00
+
Наш сайт выгодно отличается тем что при покупке, кроме PDF версии Вы в подарок получаете работу преобразованную в WORD - документ и это предоставляет качественно другие возможности при работе с документом
Страницы оглавления работы

Список использованных сокращений
Обзор литературы
Часть I. Аппарат транскрипции у эукариот
Глава 1.1. Транскрипция у эукариот, РНК-полимеразы
Глава 1.2. РНК-полимераза II
Глава 1.3. Области контроля транскрипции (TCR)
Промотор
ТА ТА-элемент
Инициатор

CpG-островки
Глава 1.3. Проксимальные и дистальные элементы,
энхансеры
Глава 1.5. LCR, MAR
Глава 1.6. Инициация транскрипции РНК-полимеразой II
Часть II. Факторы транскрипции
Глава 2.1. Компоненты транскрипционного аппарата
Глава 2.2. Общие факторы транскрипции (GTF)

TFIIA
TFIIBuZZ..."
TF11F
TFIIH и TFIIE
Глава 2.2. Активаторы и репрессоры
ДНК-связывающие домены активаторов (DBD)
Домены активации и репрессии
Глава 2.4. Ко регуляторы
TFIID

Медиатор
Глава 2.5. Посттранскрипционные события
Часть III. Разнообразие мобильных элементов
Глава 3.1. Краткая характеристика и классификация
мобильных элементов
Глава 3.2. ДНК-транспозоны или мобильные элементы
класса II
IS прокариот
ДНК-транспозоны
Глава 3.3. Общая характеристика ретроэлементов

Глава 3.4. Ретроэлементы, не содержащие LTR
Ретроинтроны
Группа LINE
SINE-элементы
Псевдогены
Процессироваиные псевдогены
Псевдогены, возникшие при дупликации геномной ДНК
Судьба псевдогенов
Экспериментальная часть
Объект и задачи исследования
Гены enhancer of yellow
Общее описание
Белок Enhancer of yellow 2 (Е(у)2)
Влияние мутации e(y)2ul на транскрипцию
Белок Е(у)2 эволюционно консервативен
Активация транскрипции in vitro и взаимодействие с хроматином
Е(у)2 входит в состав белкового комплекса и взаимодействует с белками-компонентами комплекса TFIID
Цели работы
Материалы и методы
Реактивы
ig Работа с Drosophila melanogaster
Программное обеспечение, базы данных
Работа с ДНК
Приготовление компетентных клеток и трансформация. Выделение плазмидной ДНК. Рестрикция, лигирование,
переосаждение ДНК, гель-электрофорез

Секвенирование ДНК
Введение радиоактивной метки в ДНК-зонд
Клонирование гена е(у)2Р
Работа с РНК
Выделение тотальной РНК
Очистка поли(А) РНК
'4$ Получение кДНК, обратный ПЦР
Нозерн-блот-анализ
Работа с белками
Экспрессия и очистка рекомбинантных белков
Получение антител и их очистка
Белковый гель-электрофорез
Иммуноблоттииг (вестерн-блот-анализ)
Дот-блот
Выделение эмбрионального ядерного экстракта
Выделение белкового экстракта из семенников
Детекция активности р-галактозидазы
Результаты
Геномная характеристика е(у)2Р
Поиск белков Drosophila melanogaster, гомологичных Е(у)2

Клонирование и структура е(у)2Р
Анализ экспрессии е(у)2Р у Drosophila melanogaster
Нозерн развития
Нозерн-блот-анализ тканей
Экспрессия е(у)2Р в тестисах
Экспрессия е(у)2Р под контролем промотора гена Su(Hw)
Для того, чтобы проверить, являются ли функции белков Е(у)2Р и Е(у)2 идентичными, была создана конструкция, в которой кДНК е(у)2Р находится под контролем конститутивного промотора гена , Su(Hw) и получена трансгенная линия мух, несущая данную
Щ конструкцию
Анализ прилегающих областей гена е(у)2Р D. melanogaster
Анализ гомологов е(у)2
е(у)2 в различных организмах
Гены е(у)2, е(у)2Р у Drosophila pseudoobscura и Drosophila
melanogaster
Ген е(у)2 является ретрокопией гена е(у)2Р
Обсуждение результатов
Структура гомологов белка Е(у)2 у различных организмов
Ген е(у)2Р D. melanogaster экспрессируется в семенниках
Белок Е(у)2 функционально заменил белок Е(у)2Р
Предсказанный промотор гена е(у)2 находится в районе
Щ встраивания МЭ Stalker в линии e(y)2uI
Уникальность примера генов е(у)2 и е(у)2Р
Выводы
Благодарности
Список литературы

транскриптазы, а в некоторых случаях также и домены цинковых пальцев (они же CH-мотивы) и РНКазы Н [98-100]. Среди LINE встречаются элементы, содержащие только одну ORF - либо ORF1 (элементы CM-gag и НеТ-А), либо ORF2 (более многочисленные примеры; элементы NeSL-1, CRE, RI, R2, RTE)
[100]. Кроме того, есть примеры LINE, содержащих дополнительную ORF (ORF3)
[101].
Домен RT, состоящий из 440 аминокислот, гомологичен ревертазам ретроинтронов и ретровирусов и включает в себя 11 консервативных блоков. На 5’-конце элементов, называемом 5’-UTR, расположен промотор РНК-полимеразы
II. На 3’-конце LINE находится З’-UTR и, сразу за ним - поли(А) “хвост”. Как и другие ретроэлементы, LINE фланкированы прямыми повторами различной длины (обычно от 4 до 18 п.н., но у элемента RTE1 из генома C. elegans - до 200 п.н.) [99,100].
Для LINE характерна частая усечённость копий с 5’-конца, поэтому иногда довольно трудно определить истинный 5’-конец ретроэлемента. Например, короткие усечённые копии ретропозона приматов L1 сначала были описаны как отдельный мобильный элемент [102], а укороченные копии F-элемента (LINE из генома D. melanogaster) вплоть до недавнего времени были известны под названием ретропозона Suffix [103]. По этой причине нумерацию нуклеотидов в последовательности LINE часто ведут с З’-конца и выражают в отрицательных числах. Усечённость объясняется, по-видимому, абортивной обратной транскрипцией, когда синтез кДНК по какой-то причине обрывается, не дойдя до 5’-конца РНК-матрицы.
Количество копий LINE-элементов сильно варьирует у разных таксономических групп (ретропозопы данного типа описаны для большинства изученных эукариотических организмов). Одним из немногочисленных исключений является геномы дрожжей Saccharomyces cerevisiae и Schizosaccharomyces pombe, где LINE не обнаружены [97, 104]; зато геном дрожжей Candida albicans содержит LINE [105].
Считается, что для млекопитающих характерно наличие небольшого числа семейств LINE (возможно, только одного - L1 [102, 105]) - но это малое число семейств представлено огромным количеством копий (например, около 5x105 копий L1 находятся в геноме человека, что составляет примерно 17% всей геномной ДНК). Большинство этих копий дефектно (например, в геноме человека

Рекомендуемые диссертации данного раздела

Время генерации: 0.145, запросов: 967