Моделирование эпидемического процесса гепатита В на основе компьютерных технологий

• Автор: Асатрян, Марина Норайровна
• Шифр специальности: 14.02.02
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2013
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 112 с. : 46 ил.

Оглавление
Перечень сокращений и условных обозначений
Введение
Глава I Обзор литературы
1.1 Современные особенности эпидемиологии гепатита

1.2 Эпидемиологическое значение мутантов вируса гепатита В

1.3 Математическое моделирование эпидемического процесса гепатита В
3.1 Ретроспективный анализ динамики и тенденций заболеваемости острым гепатитом В на территории федеральных округов и в Российской Федерации
за 1991-2011 гг

3.2 Динамика заболеваемости хроническим гепатитом В на территории федеральных округов и в Российской Федерации за 1999-2011 гг
3.3 Динамика уровня носительства вируса гепатита В на территории федеральных округов и в Российской Федерации за 1999-2011 гг
3.4 Масштабы вакцинопрофилактики ГВ, распределение больных ОГВ по возрастным группам и особенности структуры путей передачи вируса
гепатита В
Глава IV Разработка модели эпидемического процесса гепатита В и результаты моделирования распространения вируса гепатита В
4.1 Разработка модели распространения «дикого» штамма вируса ГВ
4.1.1 Разработка теоретической модели распространения «дикого» штамма вируса гепатита В
4.1.2 Описание математической модели распространения «дикого» штамма вируса гепатита В
4.1.3 Оценка адекватности модели
Глава II Материалы и методы исследования
Собственные исследования
Глава III Ретроспективный анализ заболеваемости гепатитом В

4.1.4 Результаты моделирования распространения дикого штамма вируса гепатита В на территории Российской Федерации
4.2 Разработка модели распространения «дикого» штамма вируса гепатита В с учетом появления и распространения НВзА§-мутантных вариантов
4.3 Компьютерная реализация модели эпидемического процесса ГВ
Глава V Прогнозирование проявлений эпидемического процесса гепатита
В в России, в том числе с учетом появления HBsAg-мyтaнтныx
вариантов
5.1 Прогнозная оценка влияния параметров модели у(1)*и 2Ш** на динамику
распространения НВзА§-мутантных вариантов
5.2 Прогнозная оценка влияния масштабов вакцинации против гепатита В
(«дикого» штамма) на динамику распространения НВзА§-мутантных
вариантов
5.3 Поиск мер противодействия распространению НВзА§-мутантных
вариантов
5.4 Разработка перспективной специализированной компьютерной системы
«ЭпидМод+ГИС»
Заключение
Выводы
Список литературы

Перечень сокращений и условных обозначений
ГВ - гепатит В ВГВ - вирус гепатита В
ВОЗ - Всемирная организация здравоохранения
ГЦК - гепатоцеллюлярная карцинома
ДНК - дезоксирибонуклеиновая кислота
ЛПК - лейкоциты периферической крови
ЛПУ - лечебно-профилактические учреждения
МТЭ - математическая теория эпидемий
ОГВ - острый гепатит В
ОРС - открытая рамка считывания
ПЦР - полимеразная цепная реакция
РНК - рибонуклеиновая кислота
ХГВ - хронический гепатит В
ХЗП - хронические заболевания печени
ФО - федеральный округ
ЭП - эпидемический процесс
Анти-НВсоге - антитела к HBcAg
Анти - НВэ - антитела к HBsAg
HBcAg - НВс-антиген
HBeAg - НВе-антиген
HBsAg - НВк-антиген

После внедрения программы всеобщей вакцинации в Тайване увеличилась доля обнаружения мутантов S-гена ВГВ, особенно G145R и ST126A/S (48 %) среди вакцинированных лиц заболевших ВГВ [93]. В то же время, совершенствование методов диагностики позволяет создавать тест-системы нового поколения, такие как: имунореферентные тест-системы с чувствительностью 0,01 нг/мл [135], учитывающие вариабельности HBsAg, тест системы реал-тайм ПЦР, или ПЦР в режиме реального времени (Real-time polymerase chain reaction (PCR)), для выявления ДНК ВГВ с чувствительностью 100 геномных эквивалентов в мл [62,161]. В работе [62] с использованием ПЦР в реальном времени, среди исследованных образцов, мутантные штаммы составили 5%. В Японии, где не проводилась массовая вакцинация, было проведено исследование [124] среди двух групп: первая группа была составлена из детей 1-14 лет заразившихся вертикально от матерей, вторая была составлена из невакцинированных лиц от 1 года до 52 лет носителей ВГВ. Тестирование при помощи ПЦР в реальном времени выявило 5,6% «а»- детерминантных мутантов в первой группе и 9,3% во второй. В то же время, прямое секвенирование ( direct sequencing) не выявило штамм G145R в качестве доминантного. Тем не менее, клонирование продуктов ПЦР (Cloning of PCR products) позволило обнаружить штамм G145R в качестве минорного в 5,6% образцах из первой группы и 6,5 % - из второй группы.
Таким образом, из вышеизложенного следует, что распространенность HBsAg-мутантов составляет от 0,5% до 12 % в различных регионах. Одним из наиболее распространенных видов является мутант «вакцинального бегства» G145R. Исследование, проведенное в Японии, с использованием новейших тест систем выявило, что мутант G145R встречается достаточно часто (5,6-6,5%) в популяции у детей и взрослых, в качестве минорного штамма. Несмотря на то, что механизм возникновения мутантов «вакцинального бегства» остается неясным, существующие мутанты (в качестве