Генетические ассоциативные исследования предрасположенности к злокачественным новообразованиям мозга у детей

• Автор: Белопольская, Олеся Борисовна
• Шифр специальности: 03.02.07
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2013
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 139 с. : ил.

Генетические ассоциативные исследования предрасположенности к злокачественным новообразованиям мозга у детей

Введение
1 Роль средовых и генетических факторов в развитии злокачественных опухолей ЦНС у детей, и в развитии осложнений лучевой терапии (обзор литературы)
1.1 Средовые факторы, влияющие на развитие злокачественных опухолей ЦНС у детей
1.2 Характеристика детских опухолей мозга
1.3 Генетические факторы, влияющие на развитие опухолей мозга у детей
1.4 Развитие осложнений в связи с применением лучевой терапии
1.5 Персонализированная медицина и фармакогенетика
1.6 Обоснование выбора исследуемых локусов
1.7 Современные методы оценки действия генов в мультифакторных заболеваниях
2 Материалы и методы
2.1 Изученные выборки
2.2 Цитогенетический тест на соматическую мутабильность
2.3 Генотипирование по генам кандидатам
2.3.1 Выделение ДНК
2.3.2 Полимеразная цепная реакция (ПЦР)
2.4 Статистическая обработка полученных результатов
3 Изучение роли полиморфизма генов в заболеваемости ЗНО мозга (Результаты и обсуждение)
3.1 Анализ гомогенности контрольной выборки по исследуемым локусам
3.2 Анализ ассоциаций заболеваемости с генотипами по исследуемым генам
3.2.1 Анализ ассоциаций заболеваемости с генотипами во всей выборке
больных детей
3.2.1.1 Однолокусные эффекты

3.2.1.2 Мультилокусные эффекты
Анализ гаплотипов
Мультилокусный анализ
3.2.2 Мета-анализ
3.2.2.1 Мета-анализ ассоциации делеционного полиморфизма гена ОБТМ1 с заболеваемостью опухолями мозга
3.2.2.2 Мета-анализ ассоциации делеционного полиморфизма гена бЭТТ/ с заболеваемостью опухолями мозга
3.2.3 Анализ различий ассоциаций генотип-болезнь у лиц разного пола в выборке европейцев
3.2.3.1 Однолокусные эффекты
3.2.3.2 Мультилокусные эффекты
Анализ гаплотипов
Мультилокусный анализ
3.2.4 Анализ различий ассоциаций генотип-болезнь у европейцев разного пола с учетом возраста вступления в период полового созревания
3.2.4.1 Однолокусные эффекты
3.2.4.2 Мультилокусные эффекты
Анализ гаплотипов
Мультилокусный анализ
3.3 Влияние облучения на организм человека в зависимости от генотипа по исследуемым локусам
3.3.1 Изменчивость частоты индуцированных хромосомных аберраций в зависимости от генотипов по кандидатным локусам у молодых здоровых добровольцев
3.3.1.1 Однолокусные эффекты
3.3.1.2 Комбинации генов, ассоциированные с вариабельностью частоты индуцированных хромосомных аберраций
3.3.2 Анализ ассоциаций постлучевых осложнений с исследуемыми
генотипами

Заключение
Выводы
Список сокращений
Список работ, опубликованных в журналах из списка ВАК
Работы по теме диссертации, опубликованные в других изданиях
Список тезисов
Список использованных источников
Приложения

Для изучения ассоциации заболевания опухолями мозга с генетическим полиморфизмом ДНК были взяты образцы периферической крови у 303 детей со злокачественными опухолями ЦНС (168 мальчика и 135 девочек), находившихся на лечении в лаборатории детской рентгенорадиологии ФГУ РНЦРР Росмедтехнологий в 2007-2012 годах. Все исследуемые нами опухоли мозга являлись злокачественными. Исследование было одобрено Этической комиссией ФГУ РНЦРР Росмедтехнологий. Включение детей в исследование во всех случаях производился после подписания родителями больных детей формы информированного согласия.
Средний возраст больных детей 8,66±0,24 лет. Наиболее распространенные опухоли в изученной когорте - это эмбриональные опухоли мозга (N=123) (в т.ч. медуллобластома (N=105), примитивные нейроэктодермальные опухоли (N=12), другие эмбриональные опухоли (N=6)) глиальные опухоли мозга (N=161) (в т.ч. опухоль ствола мозга (N=51), анапластическая эпендимома (N=45), глиобластома (N=32), астроцитома (N=33)). Также в когорте представлены герминогенные опухоли (N=15), другие опухоли мозга (N=4). Контрольная группа состояла из 467 человек со средним возрастом 27,40 ± 0,43 лет.
В таблице 3 приведено количество случаев каждого заболевания в исследуемой выборке и их относительные частоты в выборке.
Для изучения влияния аллелей исследуемых локусов на частоту индуцированных аберраций хромосом были взяты образцы периферической крови у 115 молодых здоровых мужчин - курсантов Военно-технического университета (г. Балашиха). Исследования были одобрены Этическими комиссиями ИОГен РАН и Военно-технического университета. Забор крови во всех случаях производился после подписания формы информированного согласия. Цитогенетический анализ был проведен для 96 добровольцев при изучении частоты спонтанных аберраций и для 99 человек по тесту индуцированных аберраций.