Модифицированные пиримидиновые рибонуклеозиды - ингибиторы РНК-содержащих вирусов

• Автор: Иванов, Максим Андреевич
• Шифр специальности: 03.01.03
• Научная степень: Кандидатская
• Год защиты: 2012
• Место защиты: Москва
• Количество страниц: 115 с. : ил.

СОДЕРЖАНИЕ
1. СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
2. ВВЕДЕНИЕ
3. Бициклические фурано-, пирроло- и тиофено[2,3-с1]-производные пиримидиновых нуклеозидов - синтез и противовирусные свойств
(Обзор литературы)
4-6. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
4.1. Синтез и биологическая активность фурано- и пирроло[2,3-4]пиримидиновых
нуклеозидов и их 5’-0-трифосфатов
4.1.1. Получение 6-замещенных 3-ф-1>-Рибофуранозил)-2,3-дигидрофурано[2,3-пиримидин-2-онов (За)-(Зц)
4.1.2. Получение 3-(Р-£>-Рибофуранозил)-6-гексил-2,3-дигидропирроло[2,3-(і-пиримидин-2-онов (4а) и (5£)
4.1.3. Спектральные характеристики фурано- и пирроло[2,3-/]пиримидиновых нуклеозидов
і 4.1.4. Ингибирование репликации НСУ и ВУОУ фурано- и пирроло[2,3-Д]-
пиримидиновыми нуклеозидами
4.1.5. Синтез 5’-£?-трифосфатов фурано- и пирроло[2,3-с/]-
пиримидиновых нуклеозидов
4.1.6. Спектральные характеристики 5’-0-трифосфатов фурано- и пирроло[2,3-с1]пиримидиновых нуклеозидов
4.1.7. Субстратные свойства 5’-0-трифосфатов фурано- и пирроло[2,3-<Д-пиримидиновых нуклеозидов по отношению к ферментам ВГС:
белку N858 и N83
4.1.8 5’-0-трифосфат 6-гексил-фурано[2,Зч(]пиримидина (7а) в реакциях элонгации,
катализируемых ТОТ и ЯТ
5.1. Синтез и биолологическая активность производных А*-гидроксицитидина
6.1. Синтез и биолологическая активность пиримидиновых 4 ’-фторнуклеозидов
и 5’-трифосфата 4’-фторуридина
6.1.1. 4’-Замещенные фторпроизводные нуклеозиды
6.1.2. Синтез 4,-фтор-2’,3’-0-изопропилиденуридина
6.1.3 Синтез 5’-О-ацетилцилированных пиримидиновых 4’-фторнуклеозидов
6.1.4. Спектральные характеристики пиримидиновых 4’-фторнуклеозидов
6.1.5. Токсичность 5’-0-ацетилцилированных 4’-фторнуклеозидов. Ингибирование
репликации НСУ 5’-0-ацетилцилированными 4’-фторнуклеозидами
6.1.6. Синтез 5’-0-трифосфата 4’-фторуридина
6.1.7. Исследование стабильности 5 ’-О-монофосфата и
5’-0-трифосфата 4’-фторуридина; субстратные свойства 5’-0-трифосфата 4’-фторуридина по отношению к ферментам ВГС: белку Ш5В и N83
7. ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ
7.1. Реактивы и оборудование
7.2.1. Методики к разделу
7.2.2. Методики к разделу
7.2.3. Методики к разделу
8. ВЫВОДЫ
9. БЛАГОДАРНОСТИ
10. ЛИТЕРАТУРА
11. ПРИЛОЖЕНИЕ
12. ПРИЛОЖЕНИЕ

1. СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
БПН - бициклический пиримидиновый нуклеозид;
ФПН - фуранопиримидиновый нуклеозид;
ТЕАВ - триэтиламмонийбикарбонат;
HCV - вирус гепатита С;
BVDV - вирус диареи крупного рогатого скота;
VV - вакциния вирус;
CMV - цитомегало вирус;
VZV ТК - тимидин киназа вируса варицелла зостер
ТК" VZV - штамм вируса варицелла зостер с дефицитом тимидил киназы;
ТК+ VZV - штамм вируса варицелла зостер без дефицита тимидил киназы;
HSV-1 — вирус герпеса - тип 1 ;
HSV-2 - вирус герпеса - тип 2;
ECjo - эфективная концентрация (мкМ), подавляющая репликацию вируса на 50%; СС50 - доза препарата, вызывающая гибель 50% неинфицированных клеток;
IS - индекс селективности (отношение СС50 к ЕС50)
Рс1[РРЬз]4 - тетракис(трифенилфосфин)палладий (0);
Протонная губка -1,8-бис(диметиламино)нафталин;
NHC - р-0-14-гидросицитидин;
Ada - Адамантан;
CDI - А, А’-карбонилдиимидазол;
BSA- А.О-бис триметилсилил-ацетамид;
DBAD - дибензилазодикарбоксилат;
Fmoc - 9-флуоренилметилоксикарбонил;
HMDS-1,1,1,3,3,3 -гексаметилдисилазан;
TMS-трифлат - триметилсилилтрифторметансульфонат

2. ВВЕДЕНИЕ
Заболевания, вызываемые вирусньми инфекциями являются чрезвычайно широко Сраспространенными и зачастую трудно поддаются лечению. Самый эффективный способ борьбы с бактериальными инфекциями - вакцинация, в случае вирусов ограничена вследствие различных факторов, главным из которых является быстрое образование резистентных форм. Антибиотики на вирусы, как правило, не действуют, и их применение в большинстве случаев целесообразно лишь для предупреждения бактериальных осложнений. В связи с этим одной из основных задач, стоящих перед исследователем, является поиск веществ, обладающих антивирусной активностью, проводящийся среди огромного числа классов органических соединений. Среди последних важное место занимают производные компонентов нуклеиновых кислот, в первую очередь нуклеозидов. К настоящему времени на основе модифицированных нуклеозидов создано несколько десятков эффективных препаратов для терапии вирусов разных классов [1 - 3]. Интенсивное развитие химии нуклеозидов обеспечило создание новых соединений, обладающих высокой антивирусной активностью и низкой токсичностью. При этом структурное разнообразие таких производных чрезвычайно велико, учитывая богатство синтетических возможности химии нуклеозидов. Мишенями их действия в первую очередь являются вирусные ферменты различных классов, - ДНК- и РНК-полимеразы, синтазы, киназы и многие другие, субстратами которых являются нуклеозиды, нуклеотиды и нуклеиновые кислоты.
Целью настоящей работы явился синтез и изучение свойств потенциальных ингибиторов РНК-содержащих вирусов (вирусов гепатита С (НСУ), диареи крупного рогатого скота (ВУОУ), а также вируса оспы) на основе нуклеозидов, модифицированных как по нуклеиновому основанию, так и по углеводному остатку.
Гепатит С относится к наиболее широко распространенным и опасным инфекциям. Его этиологический агент, вирус гепатита С (НСУ), одноцепочечный РНК-содержащий вирус, принадлежащий к семейству Р1атп<1ае, род Нерастгш, был впервые

позицию пиримидинового кольца вводились в IUAA реакцией Соногаширы (схема 11).
Схема
PhCH26 OCH2Ph
(84)
85а, 87а R: С4Н9 85b, 87b R: С5НИ 85с, 87с R: C6Hi3 85d, 87d R:C8H17 85e, 87e R: CH(OH)C5Hn 85f, 87f R: (CH2)3-C=CH
PhCH2Cf TCH2Ph
(85,86)
PhCH2CJ OCH2Ph
(87, 88)
86a, 88a R: (CH2)2Ph 86b, 88b R: p-Ph-Br 86c, 88c R: /?-Ph-CH3 86d, 88d R: />Ph-C4H9 86e, 88e R: /7-Ph-C5H] j
Реагенты: і: 1-алкин, PrjEtN, (PPhPd, Cul, DMF, rt; ii: Et3N, Cul, 60 °С
Соединения (85) - (88) испытывали против широкого спектра вирусов. Ни одно из них не проявило сколь либо значимой противовирусной активности. БПН (87с) оказалось единственным соединением, ингибирующим репликацию обоих лабораторных линий CMV (штаммы AD-169 и Davis).
Отсутствие гидроксильных групп в производных аскорбиновой кислоты исключает возможность фосфорилирования соединений. Поэтому не удивительна равная анти- VZV-активность против ТК+- и ТК~линий, ЕС50>1.6 мкМ для (87с).
В то же время, эти аналоги БПН проявили противоопухолевые свойства. Среди, изученных в данной работе соединений, б-бутил- (87а) и 6-и-бромфенил (88Ь) фурано[2,3-